35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4068 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  100 
 
 
202 aa  385  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  72.57 
 
 
198 aa  257  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  28.02 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  26.67 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  26.67 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  26.67 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  29.41 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  26.18 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  29.74 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  25.99 
 
 
211 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  26 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  26 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.47 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  30.73 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  31.12 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  30.3 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  31.12 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  29.84 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  27.23 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  24 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  28.03 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  27.98 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  28.88 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  19.9 
 
 
208 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  25.39 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  24.37 
 
 
250 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  19.9 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  23.56 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  23.56 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  29.02 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  24.75 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  23.44 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  22.95 
 
 
228 aa  42  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  24.63 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>