48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4479 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 199 aa  384  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  53.81 
 
 		 211 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  54.55 
 
 		 189 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  48.11 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  41.97 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  34.76 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  42.19 
 
 		 198 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  34.29 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  41.18 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  35.96 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  41.4 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  35.12 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  41.49 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  36.18 
 
 		 151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  34.63 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  34.63 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  34.98 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  40.96 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  39.13 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  34.31 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  38.07 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  40.54 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  40 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  38.3 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  41.15 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  39.49 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  36.49 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  39.57 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  39.68 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  33.7 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  37 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  35.98 
 
 		 249 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  35.57 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  35.33 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.13 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  37.09 
 
 		 255 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  30.69 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  30.69 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  33.51 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  36.15 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  28.1 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  30.06 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  30 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  26.63 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  31.71 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  31.86 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>