49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1370 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  75.12 
 
 		 205 aa  318  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  73.17 
 
 		 205 aa  314  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  73.17 
 
 		 205 aa  314  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  40.29 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  41.67 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  35.68 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  35.68 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  35.68 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  42.5 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  35.61 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  33.17 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  34.69 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  33.17 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  34.95 
 
 		 238 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  33.49 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  33.02 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  30.29 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  31.1 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  31.61 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  29.35 
 
 		 249 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  33.51 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  31.91 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  36.14 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  32.98 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  35.67 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  33.17 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  28.06 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  28.84 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  28.84 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  31.58 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  35.64 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  30.85 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  32.55 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  34.34 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  33.66 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  32.02 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  31.34 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  30.73 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  28.36 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  29.76 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  25 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  32.81 
 
 		 139 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  28.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  28.23 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  31.9 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  22.67 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  34.12 
 
 		 220 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>