48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4404 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  97.84 
 
 
232 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  55.17 
 
 
250 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  51.95 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  47.33 
 
 
249 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  50.25 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  46.84 
 
 
228 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  44.66 
 
 
224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  44.66 
 
 
224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  43.28 
 
 
224 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  45.28 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  40.41 
 
 
214 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  33.65 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  33.65 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  37.1 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  33.03 
 
 
211 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  38.62 
 
 
199 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  38.62 
 
 
199 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  38.62 
 
 
199 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  39.18 
 
 
214 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  36.04 
 
 
198 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  35.68 
 
 
189 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  31.34 
 
 
204 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  34.5 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  31.82 
 
 
151 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  37.81 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.33 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.33 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  33 
 
 
205 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  33.8 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  36.32 
 
 
199 aa  85.1  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  30.96 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  35.38 
 
 
201 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  35.24 
 
 
199 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  35.58 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  34.29 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  34.27 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  34.29 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  35.1 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  32.05 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  33.82 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  33.33 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  28.85 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  26.21 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  27.22 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  33.33 
 
 
139 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  46.81 
 
 
79 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  27.27 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>