45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4997 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  62.78 
 
 		 224 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  62.78 
 
 		 224 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  46.76 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  42.38 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  46.97 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  42.64 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  40.4 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  43.23 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  40.7 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  45.6 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  41.88 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  40.8 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  29.91 
 
 		 208 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  29.91 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  31.94 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  28.05 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.38 
 
 		 204 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  30.77 
 
 		 151 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  32.54 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  29.15 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  30.77 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  30 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  27.75 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  27.75 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  27.75 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  26.32 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  30.41 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  29.49 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  30.2 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  32.26 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  28.17 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  28.17 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  28.64 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  28.64 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  31.37 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  30.88 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  29.49 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  29.3 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  30.1 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  27.27 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  33.73 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  29.38 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  29.53 
 
 		 139 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  24.88 
 
 		 202 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>