47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4463 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  100 
 
 
214 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  96.26 
 
 
214 aa  362  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  46.6 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  42.65 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  43 
 
 
238 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  39.71 
 
 
250 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  39.17 
 
 
208 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  40.93 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  39.7 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  38.71 
 
 
208 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  39.89 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  40.64 
 
 
220 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  38 
 
 
232 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  39.88 
 
 
151 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  35.18 
 
 
198 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  35.11 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  34.65 
 
 
199 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  34.65 
 
 
199 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  34.65 
 
 
199 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  30.65 
 
 
211 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  25.91 
 
 
204 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  34.83 
 
 
198 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  31.98 
 
 
189 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  31.4 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  32.37 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  34.33 
 
 
198 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  28.92 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  32.32 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  31.82 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  32.23 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  31.03 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  30.81 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  30.54 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  30.54 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  33 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  30.58 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  30.58 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  31.84 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  31.9 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  31.6 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  30.24 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  26.21 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  29.33 
 
 
139 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  24.03 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  26.46 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>