45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2866 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  58.14 
 
 
238 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  47.6 
 
 
250 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  52.55 
 
 
212 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  48 
 
 
232 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  48 
 
 
232 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  40.65 
 
 
224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  40.65 
 
 
224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  42.86 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  43.66 
 
 
220 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  40.4 
 
 
224 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  43.13 
 
 
214 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  35.05 
 
 
208 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  34.58 
 
 
208 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  40.88 
 
 
199 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  42.65 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  38.5 
 
 
198 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  35.41 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  35.48 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  35.48 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  35.48 
 
 
199 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  33.17 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  34.54 
 
 
189 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  26.07 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  33.33 
 
 
151 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  35.95 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  30.3 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  38.07 
 
 
198 aa  85.9  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  29.35 
 
 
205 aa  85.5  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  28.57 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  29.02 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  29.02 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  37.06 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  35.98 
 
 
199 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  33 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  31.78 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  33.17 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  36.65 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  32.09 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  31.34 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  34 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  34.01 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  28.43 
 
 
201 aa  55.5  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  29.8 
 
 
139 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  30.11 
 
 
204 aa  42.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>