45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3211 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  58.39 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  44.87 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  43.87 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  39.88 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  46.79 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  48.62 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  45.1 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  45.81 
 
 		 200 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  45.81 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  44.16 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  46.1 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  48.39 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  46.76 
 
 		 139 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  43.14 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  44.44 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  32.04 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  32.04 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  37.01 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  31.61 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  35.95 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  31.61 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  36.84 
 
 		 199 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  36.84 
 
 		 199 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  36.84 
 
 		 199 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  30.97 
 
 		 151 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  30.63 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  34.44 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  31.68 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  35.71 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  35.17 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  39.58 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  27.12 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  31.71 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  32.32 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  32.05 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  31.82 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  27.56 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  33.79 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  33.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  28.23 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  27.78 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  27.78 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  27.91 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  27.78 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>