49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0699 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  100 
 
 
201 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  53.92 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  41.67 
 
 
205 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  40.89 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  40.89 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  40.89 
 
 
205 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  36.32 
 
 
211 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  38.86 
 
 
212 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  35.61 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  37.63 
 
 
199 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  37.63 
 
 
199 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  37.63 
 
 
199 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  35.12 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  36.87 
 
 
199 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  32.98 
 
 
189 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  37.63 
 
 
197 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  33.66 
 
 
250 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  34.64 
 
 
151 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  33.68 
 
 
198 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  35.68 
 
 
198 aa  91.3  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  33.16 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  32.35 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  34.69 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  34.67 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  34.67 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  34.85 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  34.34 
 
 
202 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  33.85 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  29.95 
 
 
249 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  34.15 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  31.31 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  29.86 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  36.32 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  29.86 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  33.98 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  31.15 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  30.05 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  36.72 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  27.37 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  32.82 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  33.7 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  31.22 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  26.56 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  39.2 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  25.96 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  28.46 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  25.25 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  29.59 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  23.68 
 
 
202 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>