45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4473 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  62.78 
 
 
224 aa  274  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  49.77 
 
 
212 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  42.99 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  45.79 
 
 
238 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  40 
 
 
228 aa  161  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  40.65 
 
 
249 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  44.27 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  41.2 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  42.59 
 
 
220 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  43.75 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  29.44 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  39.55 
 
 
214 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  29.13 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  32.04 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  32.11 
 
 
199 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  27.98 
 
 
151 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  31.13 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  28.9 
 
 
211 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  31.16 
 
 
198 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  30.35 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  30.35 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  30.35 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  29.9 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  26.27 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  31.16 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  31.16 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  29.38 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  30.88 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  28.84 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  30.56 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  26.85 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  31.19 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  26.98 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  28.44 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  27.85 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  28.31 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  27.4 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  28.5 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  27.85 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  29.21 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  35.8 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  34.74 
 
 
139 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  23.75 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>