48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  100 
 
 
200 aa  384  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  98 
 
 
200 aa  377  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  84.5 
 
 
199 aa  310  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  79.8 
 
 
197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  83.42 
 
 
201 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  82.5 
 
 
202 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  83.33 
 
 
199 aa  273  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  82.83 
 
 
199 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  73.87 
 
 
198 aa  268  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  71.72 
 
 
198 aa  237  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  71.72 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  59 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  76.43 
 
 
139 aa  188  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  50.23 
 
 
218 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  41.99 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  41.99 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  41.99 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  47.47 
 
 
255 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  40.1 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  39.23 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  39.29 
 
 
189 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  36.5 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  30.81 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  30.81 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  32.14 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  32.32 
 
 
238 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  84.62 
 
 
79 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  36.13 
 
 
249 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  28.72 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  34.31 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  32.51 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  30.54 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  31.17 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.67 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.67 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  30.96 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  33.87 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  29.21 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  29.79 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  33.7 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  31.53 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  26.96 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  26.96 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  31.32 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  32.93 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  36.67 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  30.41 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  29.55 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>