48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2868 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  100 
 
 
201 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  94.06 
 
 
202 aa  322  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  93.03 
 
 
199 aa  316  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  85.43 
 
 
199 aa  313  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  84.42 
 
 
197 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  90.05 
 
 
199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  83.42 
 
 
200 aa  280  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  83.42 
 
 
200 aa  278  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  73.1 
 
 
198 aa  259  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  73.74 
 
 
196 aa  240  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  69.7 
 
 
198 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  79.43 
 
 
139 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  55.28 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  51.67 
 
 
218 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  40 
 
 
199 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  40 
 
 
199 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  40 
 
 
199 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  44.16 
 
 
255 aa  124  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  40.82 
 
 
212 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  41.53 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  33.17 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0607  hypothetical protein  94.23 
 
 
79 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  32.85 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  36.46 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  37.24 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  36.36 
 
 
249 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  32.35 
 
 
238 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  31.94 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  34.38 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.33 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.33 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  33.16 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  31.22 
 
 
250 aa  82  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  29.74 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  32.16 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  31.22 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  29.65 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  31.63 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  33.78 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  34.57 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  28.24 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  28.24 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  27.96 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  30.15 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  39.33 
 
 
220 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  29.74 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  28.74 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  24.87 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>