47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4400 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  100 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  96.26 
 
 		 214 aa  338  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  47.57 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  43.13 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  42.11 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  41.2 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  43.5 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  41.2 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  40.7 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  39.63 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  42.49 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  39.17 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  40.64 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  41.67 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  41.18 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  36.17 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  40.49 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  35.68 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  36.55 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  36.55 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  36.55 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  31.16 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  27.83 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  31.98 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  34.33 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  32.83 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  30.92 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  31.71 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  33.83 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  29.15 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  32.34 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  31.75 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  31.03 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  30.54 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  32.55 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  31.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  31.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  31.68 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  29.56 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  31.34 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  32.5 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  31.03 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  30.24 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  26.6 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  30 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  23.38 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  25.79 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>