16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1820 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1820  permease cadmium resistance protein-like protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1729  hypothetical protein  31.49 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  28.06 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  26.7 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  26.7 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  26.06 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  24.12 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  24.62 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  26.24 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  24.24 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  24.26 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  25 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1136  permease, cadmium resistance protein  21.74 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000632381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  20 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  23.9 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  25.53 
 
 		 203 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>