122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1378 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1378  IS91 family transposase  100 
 
 
147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  89.29 
 
 
372 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  89.29 
 
 
372 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  89.29 
 
 
372 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  89.29 
 
 
372 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  89.29 
 
 
372 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  88.57 
 
 
372 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1625  putative transposase  89.29 
 
 
353 aa  253  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  87.14 
 
 
372 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  87.14 
 
 
372 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  87.14 
 
 
372 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1163  putative transposase  87.14 
 
 
372 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  85 
 
 
372 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  88.18 
 
 
342 aa  202  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0979  putative transposase  41.74 
 
 
374 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  38.17 
 
 
402 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  38.17 
 
 
402 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  38.17 
 
 
402 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  41.18 
 
 
400 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  41.18 
 
 
400 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  42.86 
 
 
398 aa  87.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4501  putative transposase  37.24 
 
 
398 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  43.27 
 
 
401 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  33.58 
 
 
399 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  38.28 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1788  putative transposase  36.43 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2958  putative transposase  36.43 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  42.39 
 
 
406 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  42.31 
 
 
396 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  32.48 
 
 
399 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0821  putative transposase  39.81 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4805  putative transposase  46.07 
 
 
402 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  38.02 
 
 
401 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  38.76 
 
 
398 aa  77  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  40.38 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6658  putative transposase  46.67 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.371491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1078  putative transposase  46.67 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  37.4 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  37.4 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  35.96 
 
 
429 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0560  putative transposase  33.88 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  33.88 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2876  putative transposase  33.88 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000173472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0885  putative transposase  36.27 
 
 
402 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1737  IS91 family transposase  80.56 
 
 
37 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0306271  normal  0.144282 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  30.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  32.95 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  38.36 
 
 
365 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2862  putative transposase  27.4 
 
 
375 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2631  putative transposase  34.29 
 
 
278 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5164  putative transposase  30.68 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0001  IS1294, transposase, truncation  33.61 
 
 
193 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.040816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  40 
 
 
409 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  40 
 
 
409 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1136  transposase  33.85 
 
 
362 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2046  putative transposase  35.44 
 
 
381 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  41.54 
 
 
397 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  34.65 
 
 
381 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  34.44 
 
 
399 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  34.44 
 
 
402 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1694  transposase  43.84 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.744875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2240  transposase  43.84 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000696981 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  34.44 
 
 
399 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  34.44 
 
 
394 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  32.14 
 
 
410 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  31.11 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  31.11 
 
 
358 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  31.11 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  31.11 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  31.11 
 
 
397 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>