128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0100 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0100  IS91 ORF  100 
 
 		 410 aa  858    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0010  IS91, transposase, truncation  93.17 
 
 		 284 aa  542  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0097  transposase  93.21 
 
 		 169 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0413363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  38.08 
 
 		 393 aa  282  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  36.32 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  36.51 
 
 		 397 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  36.05 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  36.24 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  36.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  36.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  36.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  36.05 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  36.24 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  36.24 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  36.24 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  35.98 
 
 		 396 aa  260  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  34.94 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  34.94 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  36.02 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  36.02 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  36.02 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  36.02 
 
 		 359 aa  249  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  34.97 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  36.02 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  34.13 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  34.7 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  35.73 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  35.61 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0095  hypothetical protein  92.75 
 
 		 73 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0058  hypothetical protein  23.9 
 
 		 407 aa  136  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0558  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0535  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0266  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0810  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1013  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0859  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1234  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0824  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0523  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1798  putative transposase  27.38 
 
 		 429 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.247476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0365  putative transposase  25.95 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.057361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6606  putative transposase  27.13 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7461  putative transposase  27.13 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7618  putative transposase  27.13 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0655294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2394  putative transposase  24.16 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2871  putative transposase  24.16 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4833  putative transposase  24.41 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0067  putative transposase  26.46 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0849  putative transposase  26.18 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000021207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1584  putative transposase  25 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6956  putative transposase  26.34 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3701  putative transposase  24.44 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1195  putative transposase  25.82 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3110  putative transposase  26.04 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1511  IS91 family transposase  26.12 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2035  transposase, putative  26.12 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2165  IS91 family transposase  26.12 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2212  IS91 family transposase  26.12 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2349  putative transposase  25.24 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2527  IS91 family transposase  26.4 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8453  putative transposase  26.45 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.015983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0557  transposase  24.23 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1190  putative transposase  26.1 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1724  putative transposase  26.65 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0316105  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2014  putative transposase  26.65 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2735  putative transposase  26.65 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3469  putative transposase  24.6 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0726489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3203  putative transposase  26.32 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5042  putative transposase  24.35 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0263  putative transposase  26.07 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0001  IS1294, transposase, truncation  30.11 
 
 		 193 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.040816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1684  putative transposase  26.1 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3630  putative transposase  24.76 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.954722 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3662  putative transposase  24.76 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.202625  hitchhiker  0.0000115382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>