252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4903 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  68.41 
 
 		 498 aa  676    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.41 
 
 		 498 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  68.81 
 
 		 498 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  68.41 
 
 		 498 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  68.41 
 
 		 498 aa  676    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  68.81 
 
 		 498 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  78.57 
 
 		 512 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  68.41 
 
 		 498 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  68.54 
 
 		 499 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  68.81 
 
 		 498 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  68.01 
 
 		 498 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 523 aa  1061    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  68.61 
 
 		 498 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  68.61 
 
 		 498 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 		 498 aa  700    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  78.37 
 
 		 512 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 		 499 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  69.88 
 
 		 499 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  69.22 
 
 		 498 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  67.79 
 
 		 506 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  68.01 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  78.57 
 
 		 512 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  67.67 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  54.81 
 
 		 546 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  55.56 
 
 		 553 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  45.97 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  55.2 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  45.17 
 
 		 530 aa  276  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  46.88 
 
 		 543 aa  273  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.14 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.53 
 
 		 528 aa  253  8.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  44.52 
 
 		 560 aa  246  6e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  47.1 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  42.55 
 
 		 489 aa  233  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  46.08 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.45 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  42.54 
 
 		 464 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  42.86 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  42.69 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  44.03 
 
 		 506 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  38.54 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.72 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  41.83 
 
 		 498 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.87 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  39 
 
 		 376 aa  177  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.1 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.54 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.14 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32.57 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.9 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.91 
 
 		 383 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  35.29 
 
 		 368 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  36.84 
 
 		 368 aa  107  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  35.88 
 
 		 368 aa  107  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.97 
 
 		 368 aa  103  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  32.99 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  27.05 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  24.76 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.03 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  25.69 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  24.65 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.48 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  23.17 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  22.35 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.65 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  24.3 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  26.69 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  23.74 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.44 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  24.21 
 
 		 324 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.13 
 
 		 313 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  24.9 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  23.31 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  25.09 
 
 		 316 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  26.41 
 
 		 318 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.57 
 
 		 335 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.79 
 
 		 309 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  25.81 
 
 		 335 aa  53.5  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  27.34 
 
 		 347 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.47 
 
 		 306 aa  53.5  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  24.14 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.63 
 
 		 334 aa  53.5  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  25.6 
 
 		 302 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  23.55 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  27.08 
 
 		 320 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.43 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.95 
 
 		 285 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  26.74 
 
 		 323 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  24.29 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  24.83 
 
 		 318 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  23.3 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>