247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0704 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  59.89 
 
 		 546 aa  673    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  74.19 
 
 		 553 aa  859    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  73.83 
 
 		 553 aa  848    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1143    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  43.65 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.94 
 
 		 498 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  43.13 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  42.41 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  42.8 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  42.46 
 
 		 498 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  42.75 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  42.75 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  42.21 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  62.67 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  41.83 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  46.27 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  46.27 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  46.27 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  46.05 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  62.71 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  46.49 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  62.71 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  62.71 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  44.84 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  42.63 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  46.67 
 
 		 543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  48 
 
 		 530 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.81 
 
 		 528 aa  287  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  42.67 
 
 		 560 aa  250  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  45.08 
 
 		 509 aa  239  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  44.75 
 
 		 509 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  47.04 
 
 		 489 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.86 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  38.69 
 
 		 506 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.38 
 
 		 547 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  33.78 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  41.89 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  40.96 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  37.8 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.96 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.85 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.36 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.66 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  34.67 
 
 		 376 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.79 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 387 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.55 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32.76 
 
 		 390 aa  143  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.71 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  36.36 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  33.51 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.86 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  34.52 
 
 		 379 aa  97.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.3 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.8 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  25.34 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.95 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  22.4 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  25.54 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  22.06 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  23.57 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.18 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  24.48 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.69 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.79 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.57 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.6 
 
 		 319 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.82 
 
 		 327 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  24.73 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  24.37 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  24.1 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  23.44 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.09 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  23.88 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  23.88 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  25.35 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.39 
 
 		 334 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  26.97 
 
 		 303 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.36 
 
 		 345 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  23.88 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.83 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  24.64 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  21.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.53 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.04 
 
 		 309 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  23.33 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.01 
 
 		 325 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  24.64 
 
 		 310 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  25.44 
 
 		 357 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  24.11 
 
 		 309 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  23.02 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  24.31 
 
 		 320 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  24.66 
 
 		 313 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.44 
 
 		 350 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.64 
 
 		 333 aa  54.7  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  23.97 
 
 		 309 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  25.45 
 
 		 338 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>