181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05670 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  91.14 
 
 
553 aa  1036    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  61.64 
 
 
546 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  73.83 
 
 
552 aa  857    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1141    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  43.9 
 
 
498 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.71 
 
 
498 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  43.9 
 
 
498 aa  412  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  43.9 
 
 
506 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  43.71 
 
 
498 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  43.9 
 
 
498 aa  412  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  43.71 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  43.71 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  42.78 
 
 
499 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  46.62 
 
 
498 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  42.54 
 
 
498 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  46.3 
 
 
498 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  42.61 
 
 
499 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  46.41 
 
 
498 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  46.41 
 
 
498 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  46.39 
 
 
498 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  62.24 
 
 
523 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  42.34 
 
 
499 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  46.07 
 
 
498 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  61.9 
 
 
512 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  62.37 
 
 
512 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  61.9 
 
 
512 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  43.06 
 
 
468 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  45.21 
 
 
543 aa  289  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  47.04 
 
 
530 aa  287  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.07 
 
 
528 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.92 
 
 
526 aa  264  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  42.86 
 
 
560 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  47.59 
 
 
509 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  47.24 
 
 
509 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  46.39 
 
 
489 aa  236  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  36.9 
 
 
506 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.6 
 
 
375 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  41.01 
 
 
547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  37.75 
 
 
498 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  42.47 
 
 
466 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  42.16 
 
 
464 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  38.54 
 
 
382 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.67 
 
 
407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.67 
 
 
389 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.48 
 
 
436 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  34.77 
 
 
376 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.83 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.86 
 
 
382 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.11 
 
 
387 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.18 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  32.24 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  35.14 
 
 
368 aa  103  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.71 
 
 
368 aa  103  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  37.5 
 
 
368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  35.43 
 
 
368 aa  100  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  33.33 
 
 
379 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.41 
 
 
285 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  21.91 
 
 
318 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.37 
 
 
325 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.63 
 
 
334 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  23.49 
 
 
332 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  20.49 
 
 
315 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  23.86 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  25.26 
 
 
332 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.23 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.3 
 
 
302 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  22.12 
 
 
343 aa  55.1  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.74 
 
 
356 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.11 
 
 
327 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.16 
 
 
378 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.21 
 
 
313 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  24.57 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  27.64 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  22.54 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  22.68 
 
 
310 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  23.53 
 
 
306 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  22.11 
 
 
308 aa  52  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  22.68 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  24.91 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.86 
 
 
320 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  24.91 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  28.12 
 
 
324 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  25.37 
 
 
309 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  23.26 
 
 
336 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  22.68 
 
 
310 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  24.16 
 
 
332 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  23.1 
 
 
303 aa  50.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  23.83 
 
 
349 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  25 
 
 
310 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.66 
 
 
310 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  25 
 
 
309 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.49 
 
 
309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  20.28 
 
 
310 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  24.57 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  23.81 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.96 
 
 
336 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.49 
 
 
345 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  24.79 
 
 
333 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  23.63 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>