285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3980 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  66.87 
 
 		 498 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.07 
 
 		 498 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  76.15 
 
 		 499 aa  780    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  69.28 
 
 		 498 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 		 498 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  69.65 
 
 		 512 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  67.27 
 
 		 498 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  69.45 
 
 		 512 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  66.87 
 
 		 498 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  68.34 
 
 		 523 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  67.07 
 
 		 498 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  76.55 
 
 		 499 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 		 498 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  69.65 
 
 		 512 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  66.87 
 
 		 498 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  69.28 
 
 		 498 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  84.37 
 
 		 498 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  66.87 
 
 		 498 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  69.28 
 
 		 498 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 499 aa  1023    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  66.87 
 
 		 506 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  65.46 
 
 		 498 aa  633  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  66.88 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  43.65 
 
 		 552 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  42 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  42.5 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  42.78 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  48.44 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.48 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  44.37 
 
 		 543 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.39 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  47.02 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  46.32 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  41.29 
 
 		 560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  46.84 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.22 
 
 		 375 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  47.64 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  36.74 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  41.14 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.75 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  41.01 
 
 		 382 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  41.83 
 
 		 498 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.73 
 
 		 389 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.42 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.21 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  39.43 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.36 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.99 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.57 
 
 		 390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.78 
 
 		 387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.11 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  34.71 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  33.53 
 
 		 368 aa  103  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.86 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  33.71 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  33.73 
 
 		 379 aa  94.4  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.24 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  27.62 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  26.32 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  27.02 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.21 
 
 		 309 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  25.38 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  26.9 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  25.42 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  25.32 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.51 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  25.71 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.85 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  23.02 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  25.96 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.79 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  25.44 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  25.18 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.94 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  24.36 
 
 		 338 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  25.47 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  24.68 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  24.83 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  24.83 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.37 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.32 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.31 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  24.36 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  24.33 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  23.32 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  24.34 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  24.36 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.05 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  23.65 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.05 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  25 
 
 		 349 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  22.74 
 
 		 309 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  24.82 
 
 		 331 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.45 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.55 
 
 		 350 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>