224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4212 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  67.75 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.75 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  67.34 
 
 		 498 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  69.64 
 
 		 499 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  67.75 
 
 		 506 aa  672    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  67.55 
 
 		 498 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  77.69 
 
 		 523 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  99.41 
 
 		 512 aa  1034    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  67.75 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  67.75 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  67.34 
 
 		 498 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 512 aa  1039    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  68.36 
 
 		 498 aa  689    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  67.75 
 
 		 498 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  67.75 
 
 		 498 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  67.55 
 
 		 498 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  67.34 
 
 		 498 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  69.57 
 
 		 499 aa  707    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  67.55 
 
 		 498 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  70.59 
 
 		 499 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  67.55 
 
 		 498 aa  668    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 512 aa  1039    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  67.39 
 
 		 468 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  53.8 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  54.7 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  53.53 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  54.76 
 
 		 553 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  44.76 
 
 		 530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  45.77 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.86 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.99 
 
 		 528 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  44.52 
 
 		 560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  45.97 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  42.95 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  44.97 
 
 		 509 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.89 
 
 		 375 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  39.94 
 
 		 547 aa  210  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  45.13 
 
 		 464 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  43.07 
 
 		 506 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  41.37 
 
 		 382 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  42.55 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.61 
 
 		 389 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  41.06 
 
 		 498 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.76 
 
 		 407 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  39.71 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.68 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.46 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.31 
 
 		 382 aa  151  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  34.49 
 
 		 390 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.33 
 
 		 387 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.39 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.88 
 
 		 368 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  36.05 
 
 		 368 aa  103  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.78 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  32.32 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.83 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  24.74 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  26.37 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.78 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.68 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  25.85 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.71 
 
 		 351 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.37 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  22.66 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  22.56 
 
 		 318 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.74 
 
 		 313 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 334 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  25.37 
 
 		 314 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.53 
 
 		 325 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  24.4 
 
 		 303 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.9 
 
 		 326 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.91 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.52 
 
 		 322 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  24.25 
 
 		 332 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  26.9 
 
 		 318 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  24.28 
 
 		 332 aa  53.5  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  23.21 
 
 		 331 aa  53.5  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  21.91 
 
 		 314 aa  53.5  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  22.64 
 
 		 308 aa  53.5  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  24.66 
 
 		 303 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  26.8 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  22.81 
 
 		 309 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.16 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.1 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.03 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  28.98 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  22.64 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.32 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  20.86 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  23.95 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  22.81 
 
 		 309 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  22.81 
 
 		 309 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  22.81 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  24.48 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  23.84 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.38 
 
 		 331 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.75 
 
 		 350 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  24.84 
 
 		 340 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.7 
 
 		 334 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  23.21 
 
 		 318 aa  50.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>