180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1893 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  100 
 
 		 464 aa  900    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  58.13 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  38.81 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  38.78 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  38.06 
 
 		 489 aa  316  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.03 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  48.18 
 
 		 547 aa  262  8e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  42.91 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  44.29 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  44.57 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.41 
 
 		 375 aa  213  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  47.39 
 
 		 523 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  47.01 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.01 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  47.01 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  47.01 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  47.01 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  47.01 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  43.48 
 
 		 498 aa  207  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  46.64 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  46.27 
 
 		 498 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  41.49 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  43.01 
 
 		 553 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  45.13 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  45.13 
 
 		 512 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  44.98 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  40.83 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.98 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  41.18 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  44.77 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.49 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  42.28 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  40.65 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.53 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.03 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  46.06 
 
 		 468 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  38.72 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  37.54 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.85 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.96 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  38.52 
 
 		 543 aa  183  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.07 
 
 		 382 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  37.83 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  35.79 
 
 		 376 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.92 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  44.37 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  41.14 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  41.82 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  44.68 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  44.68 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  24.32 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  30.17 
 
 		 340 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.2 
 
 		 332 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  29.53 
 
 		 335 aa  54.3  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  29.71 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  29.71 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  25.19 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  30.43 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  28.57 
 
 		 332 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  30.43 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  28.5 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.8 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.3 
 
 		 302 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  28.9 
 
 		 329 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.77 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.85 
 
 		 336 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.74 
 
 		 336 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.38 
 
 		 285 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.11 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  32.69 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  28.79 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  29.71 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  28.65 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  29.34 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.46 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  24.14 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.77 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  29.24 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  26.34 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  29.28 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  31.18 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  30.57 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  30.29 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.57 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.09 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  26.91 
 
 		 339 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1895  ATPase  26.59 
 
 		 338 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.62 
 
 		 337 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.35 
 
 		 336 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.45 
 
 		 332 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  28.66 
 
 		 337 aa  46.6  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.28 
 
 		 318 aa  46.6  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  29.74 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>