226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4212 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  86.14 
 
 
498 aa  873    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  86.55 
 
 
498 aa  877    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  86.14 
 
 
498 aa  873    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  99.6 
 
 
498 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  86.14 
 
 
506 aa  872    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  86.35 
 
 
498 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  100 
 
 
498 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  69.04 
 
 
499 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  100 
 
 
498 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  99.4 
 
 
498 aa  1015    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  67.61 
 
 
498 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  69.28 
 
 
499 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  86.75 
 
 
498 aa  878    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  99.8 
 
 
498 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  83.33 
 
 
498 aa  831    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  85.47 
 
 
468 aa  815    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  68.84 
 
 
499 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  86.14 
 
 
498 aa  873    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  86.75 
 
 
498 aa  878    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  67.76 
 
 
512 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  67.55 
 
 
512 aa  621  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  67.76 
 
 
512 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  68.81 
 
 
523 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  42.91 
 
 
553 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  42.45 
 
 
546 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  46.41 
 
 
553 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  46.41 
 
 
552 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  47.44 
 
 
543 aa  280  5e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  45.02 
 
 
530 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.47 
 
 
526 aa  262  8.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.06 
 
 
528 aa  247  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  39.71 
 
 
560 aa  240  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  46.88 
 
 
509 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  42.81 
 
 
489 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  45.49 
 
 
509 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.37 
 
 
375 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  45.93 
 
 
466 aa  209  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  42.54 
 
 
464 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  43.73 
 
 
506 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  41.67 
 
 
547 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  40.42 
 
 
382 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  43.94 
 
 
498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.73 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.56 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  40.13 
 
 
376 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.64 
 
 
407 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.37 
 
 
436 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.36 
 
 
382 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.38 
 
 
387 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.32 
 
 
383 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  34.21 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.88 
 
 
368 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  36.42 
 
 
368 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  35.47 
 
 
368 aa  100  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  35.88 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  34.46 
 
 
368 aa  98.2  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  28.04 
 
 
327 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.16 
 
 
319 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.35 
 
 
325 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.82 
 
 
302 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  25.44 
 
 
317 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  23.86 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  25.72 
 
 
332 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  22.14 
 
 
315 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.65 
 
 
313 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  25.56 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.57 
 
 
338 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  24.64 
 
 
340 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  26.45 
 
 
323 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  25 
 
 
320 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.02 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  26.39 
 
 
357 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  25.18 
 
 
317 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  23.05 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.37 
 
 
302 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  24 
 
 
335 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  25.09 
 
 
310 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  23.9 
 
 
305 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  25.56 
 
 
312 aa  53.5  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  24.32 
 
 
309 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.94 
 
 
285 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.66 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 
306 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  24.83 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 
306 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  24.48 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  29.55 
 
 
320 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  23.67 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  23.13 
 
 
318 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  24.32 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  24.32 
 
 
309 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  26.01 
 
 
332 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  23.02 
 
 
332 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  24.32 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  27.91 
 
 
329 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  25.54 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  26.54 
 
 
320 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  26.4 
 
 
324 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  26.54 
 
 
320 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>