234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2921 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  66.46 
 
 
509 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  66.26 
 
 
509 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  100 
 
 
489 aa  998    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  38.06 
 
 
464 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  38.22 
 
 
466 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  51.05 
 
 
547 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.41 
 
 
477 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  44.24 
 
 
506 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  43.56 
 
 
530 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  44.65 
 
 
382 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  44.6 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
498 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
498 aa  233  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  47.04 
 
 
498 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  46.84 
 
 
512 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  46.29 
 
 
498 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  47.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
506 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  47.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  47.08 
 
 
498 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  46.84 
 
 
512 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  46.84 
 
 
512 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  46.67 
 
 
499 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  45.94 
 
 
498 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  45.94 
 
 
498 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  46.26 
 
 
498 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  45.94 
 
 
498 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.94 
 
 
528 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  46.23 
 
 
553 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  46.47 
 
 
499 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  46.84 
 
 
499 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  45.58 
 
 
498 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  47.04 
 
 
552 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.55 
 
 
375 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.07 
 
 
389 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  46.67 
 
 
523 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.46 
 
 
526 aa  226  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  44.41 
 
 
498 aa  226  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  46.39 
 
 
553 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  47.51 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  42 
 
 
543 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  37.5 
 
 
560 aa  210  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.81 
 
 
436 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.31 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.5 
 
 
387 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  37.41 
 
 
376 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.42 
 
 
382 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  37.45 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.17 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  43.93 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  38.42 
 
 
368 aa  124  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  38.57 
 
 
368 aa  123  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  39.31 
 
 
368 aa  123  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  37.89 
 
 
368 aa  123  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  28.14 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.63 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  30.18 
 
 
332 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.46 
 
 
302 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.22 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  24.15 
 
 
315 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  27.84 
 
 
310 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  26.42 
 
 
308 aa  53.9  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.11 
 
 
318 aa  53.9  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  27.11 
 
 
339 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.72 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  26.89 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.35 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  26.79 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.84 
 
 
350 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0582  hypothetical protein  24.37 
 
 
322 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  25.46 
 
 
342 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  24.65 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  24.65 
 
 
331 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.39 
 
 
327 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  25.23 
 
 
370 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  25.61 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.07 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  29.52 
 
 
319 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  25.09 
 
 
302 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2997  ATPase  28.49 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0140199  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  24.27 
 
 
327 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  24.3 
 
 
371 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.54 
 
 
332 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  29.49 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  28.57 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  28.57 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.1 
 
 
329 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.05 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  29.49 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  27.31 
 
 
331 aa  50.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  28.02 
 
 
335 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  23.27 
 
 
322 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  29.49 
 
 
309 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  30 
 
 
318 aa  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  26.09 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  28.48 
 
 
318 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.26 
 
 
332 aa  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  25.84 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>