More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4815 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 407 aa  825    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  41.9 
 
 		 376 aa  245  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.48 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.98 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  41.84 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  41.49 
 
 		 509 aa  203  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.51 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  39.31 
 
 		 489 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  41.03 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  36.81 
 
 		 382 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  36.36 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.5 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  33.8 
 
 		 553 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  34.49 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  34.1 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  39 
 
 		 512 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  39 
 
 		 512 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  39 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  35.85 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.92 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  40.07 
 
 		 523 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  37.09 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  35.92 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.92 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  35.92 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  36.98 
 
 		 506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  35.92 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  35.92 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  35.92 
 
 		 506 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  35.26 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  33.55 
 
 		 547 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  34.94 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  34.73 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  37.42 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  37.23 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  38.57 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  35.44 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  35.02 
 
 		 499 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  35.64 
 
 		 498 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.31 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  35.64 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  35.64 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  35.64 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  35.64 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.12 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  34.94 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  35.62 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  33.2 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  31.48 
 
 		 560 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  32.25 
 
 		 543 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.43 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  32 
 
 		 368 aa  150  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  34.1 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  33.18 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  29.96 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.86 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19020  MoxR-like ATPase  24.44 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  23.64 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.76 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.6 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.17 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.05 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.14 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.74 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  25.95 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  25.63 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  26.15 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  25.54 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.6 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  24.19 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  25.7 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.15 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  24.05 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.45 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.89 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  26.92 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  23.76 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  22.74 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  25.39 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2273  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.44 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  23.18 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  26.92 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.97 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  26.49 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  27.41 
 
 		 332 aa  57  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  22.86 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.83 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.92 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  23.64 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.67 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  22.58 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  23.64 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.83 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.34 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.88 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.97 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  22.86 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35700  MoxR-like ATPase  23.42 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  26.51 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>