152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0500 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0500  ferredoxin  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04786  donor-ubiquinone reductase I  52.78 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  36.59 
 
 		 645 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  36.59 
 
 		 645 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 		 979 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 982 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 947 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1523  NADH dehydrogenase subunit G  35.56 
 
 		 779 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00317938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 		 982 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  39.76 
 
 		 666 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  33.72 
 
 		 653 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 959 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0144  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  31.82 
 
 		 825 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00169581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 967 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 959 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 959 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 1000 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.11 
 
 		 977 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 983 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 956 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 948 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  28.89 
 
 		 957 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.88 
 
 		 899 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 957 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 951 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 		 578 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 946 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  35.29 
 
 		 831 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 984 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  32.56 
 
 		 578 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 969 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 951 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  36.05 
 
 		 828 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1822  NADH dehydrogenase subunit G  32.97 
 
 		 828 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.266338  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 950 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.67 
 
 		 948 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.37 
 
 		 978 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 		 808 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 950 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  34.12 
 
 		 844 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 		 948 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.82 
 
 		 659 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 		 948 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0187  NADH dehydrogenase subunit G  32.58 
 
 		 760 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0152  hydrogenase, Fe-only  34.78 
 
 		 580 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  42.19 
 
 		 615 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  34.44 
 
 		 826 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 		 948 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  32.1 
 
 		 601 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 959 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 		 960 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1439  NADH dehydrogenase subunit G  40.54 
 
 		 817 aa  47.4  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.43 
 
 		 959 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 		 960 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2467  hydrogenase, Fe-only  31.87 
 
 		 574 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 		 960 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 959 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 		 893 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 		 973 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0172  hydrogenase, Fe-only  34.07 
 
 		 573 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  32.61 
 
 		 609 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1523  ferredoxin  36.9 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171825  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  29.13 
 
 		 667 aa  46.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0110  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 		 998 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 952 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 		 949 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.68 
 
 		 1073 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 950 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  35.56 
 
 		 815 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.17 
 
 		 946 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.56 
 
 		 933 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 989 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1744  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 820 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0980  ferredoxin  30.49 
 
 		 235 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2248  ferredoxin  32.94 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.95 
 
 		 920 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0447  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  31.82 
 
 		 656 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1558  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 820 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000186959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.78 
 
 		 944 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1924  NADH dehydrogenase subunit G  36.49 
 
 		 820 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  29.55 
 
 		 658 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1662  NADH dehydrogenase subunit G  30.43 
 
 		 766 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 952 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1299  hydrogenase, Fe-only  29.67 
 
 		 579 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.130328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 960 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 956 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.89 
 
 		 966 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>