42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04786 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04786  donor-ubiquinone reductase I  100 
 
 		 108 aa  223  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0500  ferredoxin  52.78 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  28.57 
 
 		 645 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  28.57 
 
 		 645 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1523  NADH dehydrogenase subunit G  30.3 
 
 		 779 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00317938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  33.33 
 
 		 666 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1439  NADH dehydrogenase subunit G  37.08 
 
 		 817 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0144  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  28.71 
 
 		 825 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00169581  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0187  NADH dehydrogenase subunit G  29.67 
 
 		 760 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06330  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 75 kDa subunit  30.95 
 
 		 578 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00021405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  32 
 
 		 808 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0225  hydrogenase, Fe-only  28.4 
 
 		 667 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2557  bidirectional hydrogenase complex protein HoxU  32.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 1406 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1822  NADH dehydrogenase subunit G  30.69 
 
 		 828 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.266338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1490  hydrogenases, Fe-only  26.32 
 
 		 601 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0224  hydrogenase, Fe-only  29.07 
 
 		 573 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1924  NADH dehydrogenase subunit G  35.14 
 
 		 820 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  27.5 
 
 		 653 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_155  [Fe] hydrogenase, Hym C subunit  27.91 
 
 		 573 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0147  [Fe] hydrogenase, large subunit HymC, putative  29.07 
 
 		 573 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1662  NADH dehydrogenase subunit G  26 
 
 		 766 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1461  ferredoxin  30.49 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.544429 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1558  NADH dehydrogenase subunit G  35.14 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000186959  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1744  NADH dehydrogenase subunit G  35.14 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1523  ferredoxin  32.94 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171825  hitchhiker  0.00403982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.68 
 
 		 977 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  29.55 
 
 		 982 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 		 944 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.55 
 
 		 982 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  31.82 
 
 		 899 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.41 
 
 		 969 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 983 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 957 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1548  hydrogenase, Fe-only  38.24 
 
 		 615 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.68 
 
 		 979 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.55 
 
 		 966 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>