More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1822 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1523  NADH dehydrogenase subunit G  43.9 
 
 		 779 aa  702    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00317938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1558  NADH dehydrogenase subunit G  44.54 
 
 		 820 aa  672    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000186959  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1924  NADH dehydrogenase subunit G  44.78 
 
 		 820 aa  658    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0018513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1744  NADH dehydrogenase subunit G  44.66 
 
 		 820 aa  674    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1822  NADH dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 828 aa  1708    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.266338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1439  NADH dehydrogenase subunit G  46.31 
 
 		 817 aa  699    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0144  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron- sulphur binding protein  55.6 
 
 		 825 aa  953    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00169581  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0187  NADH dehydrogenase subunit G  42.03 
 
 		 760 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1662  NADH dehydrogenase subunit G  40.7 
 
 		 766 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.65475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1823  NADH dehydrogenase subunit G  36.39 
 
 		 750 aa  548  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0660  molybdopterin oxidoreductase  25.26 
 
 		 822 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.672989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0509  Fe(III) reductase, alpha subunit  31.38 
 
 		 844 aa  207  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 822 aa  207  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3022  Fe(III) reductase, alpha subunit  29 
 
 		 831 aa  200  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  31.24 
 
 		 808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0344  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  30.97 
 
 		 826 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  27.65 
 
 		 815 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3617  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 850 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1309  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  30.94 
 
 		 788 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1538  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 		 879 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3389  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  32.1 
 
 		 923 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0334  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding protein  33.68 
 
 		 826 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3087  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.2 
 
 		 913 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.67 
 
 		 351 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4238  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 828 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.01 
 
 		 900 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  26.49 
 
 		 899 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2237  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.79 
 
 		 918 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3349  NADH dehydrogenase I, G subunit, putative  31.42 
 
 		 828 aa  161  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.407234  normal  0.217544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4004  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 		 821 aa  160  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08061e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3920  molybdopterin oxidoreductase  30.17 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.403816  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3629  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  31.88 
 
 		 797 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192772 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.66 
 
 		 917 aa  157  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.39 
 
 		 893 aa  157  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.39 
 
 		 903 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  31.46 
 
 		 310 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000710786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3187  ferredoxin  31.36 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0634  ferredoxin  31.36 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1629  ferredoxin  31.36 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1043  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.35 
 
 		 903 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.35 
 
 		 984 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 984 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.31 
 
 		 905 aa  152  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.35 
 
 		 959 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.83 
 
 		 893 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.82 
 
 		 983 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 960 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.08 
 
 		 960 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.41 
 
 		 359 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.68 
 
 		 355 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.5 
 
 		 947 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.82 
 
 		 984 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.66 
 
 		 1000 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.3 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.09 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.82 
 
 		 960 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 983 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.68 
 
 		 906 aa  148  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1148  NADH dehydrogenase subunit G  28.64 
 
 		 784 aa  147  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  34.24 
 
 		 307 aa  147  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.76 
 
 		 983 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  30.03 
 
 		 358 aa  147  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0424  ferredoxin  27.13 
 
 		 622 aa  147  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7685  NADH dehydrogenase subunit G  30.16 
 
 		 839 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  29.32 
 
 		 363 aa  147  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.09 
 
 		 901 aa  147  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.23 
 
 		 949 aa  146  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2830  NADH dehydrogenase subunit G  26.18 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.06 
 
 		 978 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.7 
 
 		 956 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2251  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.38 
 
 		 782 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000992476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2624  NADH-quinone oxidoreductase, G subunit  28.38 
 
 		 782 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.49 
 
 		 959 aa  144  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.63 
 
 		 898 aa  144  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.72 
 
 		 967 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.9 
 
 		 900 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.84 
 
 		 979 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.58 
 
 		 946 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.81 
 
 		 944 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0823  NADH dehydrogenase subunit G  28.2 
 
 		 700 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.477547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.27 
 
 		 952 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.38 
 
 		 982 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  28.12 
 
 		 982 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.2 
 
 		 957 aa  142  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2699  NADH dehydrogenase subunit G  26.96 
 
 		 783 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  28.65 
 
 		 353 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  27.56 
 
 		 977 aa  141  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0835  anaerobic dehydrogenase  32.69 
 
 		 305 aa  141  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.25 
 
 		 951 aa  141  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 		 911 aa  140  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.22 
 
 		 969 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1034  NADH dehydrogenase subunit G  26.08 
 
 		 776 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.884498  normal  0.272009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>