149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4089 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4089  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0084  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  29.59 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  27.21 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4907  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  27.34 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2091  hypothetical protein  27.38 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  29.56 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.68 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  26.36 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5407  hypothetical protein  27.24 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  28.2 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  26.52 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  28.4 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  24.64 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  29.32 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.28 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  25.57 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  28.62 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  26.62 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.47 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.28 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  31.63 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  28.9 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.1 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7002  transcriptional regulator, XRE family  27.12 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  28.36 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  27.2 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  24.66 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.38 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5233  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  23.22 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  24.07 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  25.56 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  25.46 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  25.75 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.88 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  26.17 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  26.1 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  27.98 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  27.11 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  28.26 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4780  hypothetical protein  26.46 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0107  helix-turn-helix domain protein  24.06 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  24.28 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  28.43 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  24.26 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  26.2 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  22.82 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27070  Helix-turn-helix protein  26.15 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  25.72 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  26.07 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  26.42 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.8 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.47 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  25.84 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  24.29 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  27.34 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  25.48 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  25.91 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  27.17 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  26.24 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  27.67 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  27.85 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  28.63 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  24.57 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  23.46 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  22.63 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  25.75 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  23.49 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>