More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2437 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2437  fumarate lyase  100 
 
 
477 aa  952    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  38.54 
 
 
499 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  39.54 
 
 
900 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  39.54 
 
 
900 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  39.54 
 
 
914 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
926 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
924 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
904 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
896 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
894 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 
912 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  37.12 
 
 
904 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  36.38 
 
 
891 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  37.64 
 
 
492 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
459 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  35.48 
 
 
463 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  36.86 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  33.96 
 
 
481 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  32.75 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  35.55 
 
 
520 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 
491 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  30.14 
 
 
466 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.06 
 
 
462 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  32.36 
 
 
509 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  36.61 
 
 
478 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 
459 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 
468 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 
462 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  32.78 
 
 
462 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  32.78 
 
 
463 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 
462 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 
463 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
462 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  32.78 
 
 
462 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
462 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  31.3 
 
 
462 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  36.51 
 
 
460 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
458 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 
465 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  35.97 
 
 
455 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
469 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  33.64 
 
 
462 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  36.92 
 
 
462 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  35.46 
 
 
470 aa  186  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  34.84 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  36.41 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  38.16 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1940  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  33.89 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  35.38 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  32.54 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  37.3 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  31.41 
 
 
462 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
461 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  26.76 
 
 
481 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  37.03 
 
 
475 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  30.04 
 
 
491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  35.25 
 
 
465 aa  183  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  32.41 
 
 
502 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  30.85 
 
 
487 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  31.28 
 
 
502 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  31.28 
 
 
502 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 
499 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  35.25 
 
 
463 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  33.6 
 
 
460 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 
468 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  34.24 
 
 
465 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  26.53 
 
 
481 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  35.61 
 
 
465 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1299  argininosuccinate lyase  35.25 
 
 
463 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000094319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  35.87 
 
 
468 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  26.88 
 
 
481 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  36.45 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  36.51 
 
 
624 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  33.88 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  35.85 
 
 
472 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  38.87 
 
 
468 aa  181  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  34.59 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  26.15 
 
 
502 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  26.15 
 
 
502 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  36.83 
 
 
457 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  34.78 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  36.45 
 
 
469 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  31.28 
 
 
502 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  34.08 
 
 
457 aa  179  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  31.94 
 
 
482 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 
457 aa  179  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  34.13 
 
 
500 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>