More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4386 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 499 aa  1026    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  46.83 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  35.02 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  37.47 
 
 		 492 aa  266  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  39.95 
 
 		 478 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  36.04 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  38.32 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  41.53 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  37.67 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  38.14 
 
 		 457 aa  260  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  35.59 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  39.49 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  36.59 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  37.91 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  42.78 
 
 		 473 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  38.23 
 
 		 494 aa  256  9e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  40.32 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  37.67 
 
 		 457 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  36.17 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  37.98 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  35.24 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  36.43 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  37.03 
 
 		 474 aa  253  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  34.05 
 
 		 481 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  37.15 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  38.3 
 
 		 469 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  41.24 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  36.85 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  39.2 
 
 		 455 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 		 509 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 		 462 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  40.64 
 
 		 462 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  38.07 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  37.12 
 
 		 481 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  36.93 
 
 		 464 aa  250  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  40.55 
 
 		 459 aa  250  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  37.27 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  41.24 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  41.24 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  40.91 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  38.53 
 
 		 487 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  38.77 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  33.33 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  36.56 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  35.32 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  39.78 
 
 		 462 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  38.16 
 
 		 493 aa  248  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  35.32 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  39.35 
 
 		 465 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  38.9 
 
 		 464 aa  247  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  34.5 
 
 		 458 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  35.32 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  40.37 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  38.11 
 
 		 459 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  40.32 
 
 		 462 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  40.32 
 
 		 462 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0922  argininosuccinate lyase  36.4 
 
 		 487 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.276542  hitchhiker  2.40757e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 499 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  36.49 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  41.32 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  37.12 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  37.2 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2437  fumarate lyase  38.54 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  35.45 
 
 		 462 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  36.63 
 
 		 441 aa  245  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  39.3 
 
 		 467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  38.48 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  34.84 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  35.09 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  37.33 
 
 		 462 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  36 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  36.74 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  33.72 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  38.25 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  39.35 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  34.34 
 
 		 471 aa  243  7e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 		 462 aa  243  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  38.81 
 
 		 466 aa  243  7.999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 466 aa  242  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  41.82 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  40.56 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 		 479 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  34.86 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  36.02 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  35.43 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5512  argininosuccinate lyase  36.2 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  40.43 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  36.64 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  41.1 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>