More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1078 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  100 
 
 
494 aa  1002    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  60.57 
 
 
492 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  60.21 
 
 
474 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  54.07 
 
 
493 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  56.14 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
487 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  50 
 
 
491 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  48.31 
 
 
491 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  44.4 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  42.52 
 
 
481 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  41.37 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  42.09 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
481 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  45.3 
 
 
502 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  43.99 
 
 
497 aa  351  1e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  44.83 
 
 
501 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
462 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
462 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  40.76 
 
 
462 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  40.44 
 
 
462 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
462 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
462 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  41.09 
 
 
459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
462 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
463 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  40.83 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 
463 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  40.31 
 
 
462 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  42.28 
 
 
554 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  41.34 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  43.52 
 
 
467 aa  340  4e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  40.31 
 
 
462 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1504  argininosuccinate lyase  44.75 
 
 
498 aa  339  8e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  41.06 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  41.14 
 
 
461 aa  336  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  38.49 
 
 
466 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  41.67 
 
 
464 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  42.27 
 
 
456 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  39.15 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  39.12 
 
 
458 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  40 
 
 
481 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  40.17 
 
 
458 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  40.58 
 
 
461 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  40.38 
 
 
458 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
460 aa  324  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  40.52 
 
 
458 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  39.96 
 
 
458 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  42.38 
 
 
459 aa  323  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  40.65 
 
 
458 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  40.94 
 
 
458 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  41.99 
 
 
471 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  40.84 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  37.86 
 
 
462 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  40.52 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 
467 aa  320  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  43.19 
 
 
461 aa  320  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1094  argininosuccinate lyase  41.52 
 
 
466 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0434705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  39.43 
 
 
459 aa  319  9e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  41.65 
 
 
471 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  44.05 
 
 
468 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  43.21 
 
 
464 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  40.13 
 
 
458 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  40.83 
 
 
466 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  40.9 
 
 
469 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  39.74 
 
 
462 aa  316  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  38.55 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  41.07 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  42.72 
 
 
466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  41.07 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  41.07 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  41.07 
 
 
499 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  41.15 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  41.29 
 
 
464 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  40.57 
 
 
464 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  40.81 
 
 
469 aa  313  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  41.67 
 
 
462 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  41.67 
 
 
462 aa  313  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  41.59 
 
 
471 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  40.4 
 
 
461 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  40.96 
 
 
464 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  40.85 
 
 
464 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  41.3 
 
 
467 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  40.04 
 
 
473 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  41.61 
 
 
465 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  42.86 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  40.85 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  41.29 
 
 
467 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  40.4 
 
 
459 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  41.03 
 
 
463 aa  310  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  41.41 
 
 
460 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  37.36 
 
 
460 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  41.37 
 
 
471 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  40.6 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  40.6 
 
 
493 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  38.84 
 
 
463 aa  309  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  40.87 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  38.73 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  37.03 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  41.27 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>