More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3642 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1043    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  88.54 
 
 		 499 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  45.45 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  41.55 
 
 		 463 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  39.02 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  37.25 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  40.82 
 
 		 463 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  40.82 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  44.13 
 
 		 462 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  41.31 
 
 		 462 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  34.37 
 
 		 491 aa  248  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3477  argininosuccinate lyase  39.72 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  34.76 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  40.1 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  30.59 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  38.53 
 
 		 488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  38.95 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  35.85 
 
 		 493 aa  239  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  30.37 
 
 		 481 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  30.82 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  38.8 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  38.19 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  34.41 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5988  argininosuccinate lyase  42.35 
 
 		 462 aa  233  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.156903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  38.33 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  37.65 
 
 		 463 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  38.85 
 
 		 465 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  37.59 
 
 		 464 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  37.44 
 
 		 487 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  37.2 
 
 		 464 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  36.48 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  35.33 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  37.18 
 
 		 473 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  38.73 
 
 		 478 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2065  argininosuccinate lyase  40.53 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.247909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  37.35 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  37.12 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  40.16 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  37.83 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  37.12 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  37.2 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5225  argininosuccinate lyase  37.06 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  37.38 
 
 		 469 aa  224  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  37.44 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1484  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.209695  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  31.7 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  38.48 
 
 		 476 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0726  argininosuccinate lyase  38.73 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  35.9 
 
 		 460 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  38.73 
 
 		 471 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  33.26 
 
 		 500 aa  223  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  36.77 
 
 		 494 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.38 
 
 		 624 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  39.44 
 
 		 455 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  39.44 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  37.17 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  38.98 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  37.17 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  35.21 
 
 		 481 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  37.14 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0201  argininosuccinate lyase  37.75 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  35.04 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  34.57 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  37.2 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4220  argininosuccinate lyase  38 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3062  argininosuccinate lyase  38.1 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  36.95 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4195  argininosuccinate lyase  38 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  34.66 
 
 		 624 aa  217  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  34.88 
 
 		 462 aa  217  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 		 475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  31.55 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  36.99 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  37.11 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0607  argininosuccinate lyase  33.73 
 
 		 463 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 		 464 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 		 476 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  37.92 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  35.95 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 		 513 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  36.1 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 		 478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4071  argininosuccinate lyase  37.53 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708679  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  35.89 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  36.87 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  35.68 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  36.9 
 
 		 467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.51 
 
 		 626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  35.06 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  34.47 
 
 		 466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  37.78 
 
 		 476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  33.74 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  35.14 
 
 		 624 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  34.68 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>