More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3820 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  100 
 
 
509 aa  1045    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  81.44 
 
 
513 aa  847    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  88.58 
 
 
500 aa  909    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  52.54 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  43.61 
 
 
499 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 
499 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  36.55 
 
 
491 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  34.13 
 
 
487 aa  261  3e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  34 
 
 
481 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  34.56 
 
 
481 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 
481 aa  257  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
481 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  34.5 
 
 
502 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 
499 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  33.89 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  36.19 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  33.92 
 
 
492 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  34.62 
 
 
494 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 
462 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  34.03 
 
 
462 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  32.68 
 
 
499 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 
463 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
462 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  33.71 
 
 
461 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
462 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
462 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
462 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 
462 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 
463 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
462 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  34.8 
 
 
459 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  32.1 
 
 
492 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 
478 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  34.89 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.92 
 
 
493 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  34.69 
 
 
474 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  32.21 
 
 
458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  32.87 
 
 
462 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  33.06 
 
 
478 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  37.05 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  32.63 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  34.39 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  35.85 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  31.47 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  31.47 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  32.36 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  37.57 
 
 
467 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  31.73 
 
 
458 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  34.39 
 
 
468 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  34.39 
 
 
499 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  34.63 
 
 
464 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  34.08 
 
 
467 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  34.39 
 
 
464 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  33.72 
 
 
463 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  33.48 
 
 
461 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
464 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  32.57 
 
 
469 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  35.61 
 
 
471 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  34.19 
 
 
469 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 
464 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  33.64 
 
 
459 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  31.29 
 
 
463 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  33.59 
 
 
456 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
459 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  33.48 
 
 
464 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  32.68 
 
 
469 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  32.55 
 
 
461 aa  206  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  33.01 
 
 
472 aa  206  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  35.57 
 
 
490 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  35.61 
 
 
471 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  36.81 
 
 
462 aa  206  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 
458 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  34.47 
 
 
462 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  34.33 
 
 
489 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
472 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  33.65 
 
 
466 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
485 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  34.12 
 
 
490 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 
464 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  38.2 
 
 
465 aa  204  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
476 aa  203  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  34.19 
 
 
469 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  34.73 
 
 
502 aa  203  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  29.58 
 
 
464 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  32.59 
 
 
554 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  35.81 
 
 
467 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  34.22 
 
 
470 aa  203  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
471 aa  203  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  31.17 
 
 
462 aa  202  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  31.7 
 
 
499 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  34.92 
 
 
491 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  35.29 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>