More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2629 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  100 
 
 
499 aa  1013    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 
487 aa  229  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  32.25 
 
 
499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
499 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
499 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  32.71 
 
 
492 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  29.42 
 
 
502 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  31.7 
 
 
509 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  30.58 
 
 
513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  29.54 
 
 
491 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  28.6 
 
 
487 aa  200  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  32.15 
 
 
510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  29.44 
 
 
485 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  31.62 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  32.68 
 
 
500 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
474 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  30.37 
 
 
493 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  27.51 
 
 
481 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  31.05 
 
 
497 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  28.4 
 
 
502 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  29.29 
 
 
502 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  29.29 
 
 
502 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  30.75 
 
 
491 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  29.29 
 
 
502 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  29.76 
 
 
492 aa  189  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2584  argininosuccinate lyase  30.6 
 
 
496 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0126458  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  30.35 
 
 
502 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  30.46 
 
 
491 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  28.2 
 
 
502 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  27.61 
 
 
458 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  30.64 
 
 
459 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  26.72 
 
 
481 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  26.64 
 
 
481 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  33.86 
 
 
502 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  26.32 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 
501 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  30.5 
 
 
457 aa  183  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  30.19 
 
 
469 aa  183  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  30.59 
 
 
457 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  32.39 
 
 
554 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  29.57 
 
 
468 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  29.95 
 
 
459 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  29.45 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  30.6 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  28.23 
 
 
469 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  30.81 
 
 
464 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  29.54 
 
 
485 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  29.3 
 
 
494 aa  177  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  29.3 
 
 
461 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  30.75 
 
 
472 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  26.2 
 
 
471 aa  176  7e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  26.74 
 
 
470 aa  176  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 
462 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 
462 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  28.81 
 
 
463 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  29.17 
 
 
465 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  29.81 
 
 
478 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  26.85 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  27.8 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  28.24 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  28.85 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  27.78 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  29.42 
 
 
471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  33.43 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  33.43 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  30.5 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  30.05 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1504  argininosuccinate lyase  35.31 
 
 
498 aa  174  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  32.7 
 
 
474 aa  174  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1188  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
466 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0735426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  27.21 
 
 
462 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  29.42 
 
 
471 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2482  argininosuccinate lyase  32.33 
 
 
504 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199461  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  28.37 
 
 
460 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  28.86 
 
 
468 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 
462 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  32.59 
 
 
475 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  29.82 
 
 
470 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  30.12 
 
 
499 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  28.04 
 
 
468 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  28.74 
 
 
459 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  29.15 
 
 
471 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  28.88 
 
 
458 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  27.65 
 
 
458 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  28.74 
 
 
459 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  28.3 
 
 
462 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  27.54 
 
 
466 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  28.39 
 
 
462 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  30.59 
 
 
476 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  31.83 
 
 
462 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  29.93 
 
 
489 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  27.64 
 
 
459 aa  171  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  26.62 
 
 
462 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 
455 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  30.03 
 
 
467 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  30.31 
 
 
473 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  27.91 
 
 
463 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  29.93 
 
 
469 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>