More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2390 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  100 
 
 
499 aa  1019    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  56.64 
 
 
499 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  40.33 
 
 
513 aa  356  6.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 
509 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  38.74 
 
 
500 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 
510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  36.97 
 
 
491 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  35.9 
 
 
487 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  31.36 
 
 
481 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  31.94 
 
 
481 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  35.96 
 
 
492 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
491 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  32.27 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  30.9 
 
 
481 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  36.2 
 
 
474 aa  240  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  31.21 
 
 
481 aa  240  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  35.5 
 
 
492 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  34.87 
 
 
494 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  34.42 
 
 
502 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  33.19 
 
 
499 aa  229  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  37.31 
 
 
458 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  37.62 
 
 
460 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  37.56 
 
 
458 aa  226  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  34.02 
 
 
469 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  34.97 
 
 
502 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  30.33 
 
 
502 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  34.76 
 
 
466 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  34.18 
 
 
461 aa  220  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 
463 aa  219  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  33.94 
 
 
458 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  37.34 
 
 
458 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  34.4 
 
 
458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  32.41 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  32.41 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 
466 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  28.82 
 
 
502 aa  213  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  35.23 
 
 
458 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  35.13 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 
493 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  31.37 
 
 
499 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 
459 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 
463 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  28.82 
 
 
502 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1660  argininosuccinate lyase  29.46 
 
 
502 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  32.63 
 
 
463 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  32.39 
 
 
462 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 
462 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  36.27 
 
 
458 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  34.93 
 
 
469 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  32.25 
 
 
462 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  34.41 
 
 
460 aa  210  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
499 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  32.19 
 
 
462 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.83 
 
 
493 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
466 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  35.45 
 
 
473 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  32.9 
 
 
459 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  35.25 
 
 
462 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  32.75 
 
 
520 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  35.01 
 
 
466 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 
466 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  34.21 
 
 
467 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  35.43 
 
 
467 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  37.87 
 
 
478 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  35.83 
 
 
466 aa  206  6e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  33.65 
 
 
481 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  35.2 
 
 
467 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  31.89 
 
 
461 aa  206  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  32.08 
 
 
459 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  32.85 
 
 
461 aa  206  9e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3567  argininosuccinate lyase  29.25 
 
 
502 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1327  argininosuccinate lyase  30.5 
 
 
466 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
466 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  35.28 
 
 
464 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  37.23 
 
 
465 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  34.91 
 
 
463 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2482  argininosuccinate lyase  34.13 
 
 
504 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.199461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  35.54 
 
 
464 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  34.43 
 
 
463 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  33.78 
 
 
464 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  34.43 
 
 
463 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 
455 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  35.54 
 
 
464 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  35.61 
 
 
488 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  33.84 
 
 
554 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  28.82 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  33.1 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  28.82 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3657  argininosuccinate lyase  29.25 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  34.93 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  28.6 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  28.6 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  35.6 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  32.65 
 
 
462 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  33.71 
 
 
462 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>