More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1327 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1251  argininosuccinate lyase  71.93 
 
 
463 aa  667    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1367  argininosuccinate lyase  72.77 
 
 
460 aa  695    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  73.68 
 
 
461 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  69.72 
 
 
461 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  79.74 
 
 
460 aa  767    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1327  argininosuccinate lyase  100 
 
 
466 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1327  argininosuccinate lyase  70.82 
 
 
468 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.456779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
458 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  51.44 
 
 
462 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
458 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  51 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  51 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  49.55 
 
 
458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  51 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  51 
 
 
463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  51.22 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  51 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  50.78 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
459 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
461 aa  463  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
481 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 
461 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  47.9 
 
 
458 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  48.37 
 
 
458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
464 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
460 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
460 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
463 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
458 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 
456 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  45.05 
 
 
466 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
464 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.92 
 
 
459 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 
467 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.92 
 
 
459 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  45.51 
 
 
462 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 
459 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  45.51 
 
 
462 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  46.61 
 
 
467 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  46.44 
 
 
459 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  47.31 
 
 
466 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  47.39 
 
 
465 aa  418  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  46 
 
 
466 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  50 
 
 
441 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
464 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  45.32 
 
 
478 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 
461 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  46.48 
 
 
466 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  46.41 
 
 
469 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 
479 aa  418  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
464 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
464 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  45.96 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
468 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  44.83 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0883  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
460 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  44.89 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  47.37 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
499 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 
460 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
464 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  46.8 
 
 
464 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  45.5 
 
 
462 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  43.61 
 
 
458 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  45.83 
 
 
462 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
459 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1901  argininosuccinate lyase  46.1 
 
 
460 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  45.47 
 
 
463 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  45.25 
 
 
462 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  45.93 
 
 
475 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 
441 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0938  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 
460 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  45.76 
 
 
461 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  44.84 
 
 
458 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 
457 aa  412  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  43.6 
 
 
466 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 
468 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  45.07 
 
 
460 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 
457 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  46.58 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  45.74 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  45.31 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  43.71 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  45.43 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  44 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  47.58 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  43.3 
 
 
462 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  45.92 
 
 
463 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>