More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2366 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  100 
 
 
510 aa  1027    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  52.54 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  50.3 
 
 
500 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  50.5 
 
 
513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  40.46 
 
 
499 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 
499 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  32.92 
 
 
481 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  31.83 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  31.75 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  31.83 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  35.93 
 
 
491 aa  233  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
462 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
462 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  36.93 
 
 
478 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 
462 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
462 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
462 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
463 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 
462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
462 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
463 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.73 
 
 
462 aa  226  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
481 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  34.06 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  33.25 
 
 
458 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  33.4 
 
 
487 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  36.75 
 
 
492 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  33.4 
 
 
493 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  33.7 
 
 
491 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  34.49 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  34.05 
 
 
459 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 
458 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  34.7 
 
 
481 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 
462 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  34.74 
 
 
460 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  34.55 
 
 
463 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  33.7 
 
 
492 aa  206  7e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
463 aa  205  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  33.69 
 
 
463 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
499 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.85 
 
 
461 aa  203  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  33.98 
 
 
464 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  32.74 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3252  argininosuccinate lyase  26.58 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0272341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  34.37 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  33.19 
 
 
458 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  30.09 
 
 
471 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  35.14 
 
 
462 aa  200  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1024  argininosuccinate lyase  36.9 
 
 
465 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2224  argininosuccinate lyase  27.35 
 
 
502 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.432614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  32.39 
 
 
471 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  25.9 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  33.76 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  32.09 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  31.42 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  30.65 
 
 
499 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  32.72 
 
 
459 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  33.55 
 
 
471 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  32.46 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3258  argininosuccinate lyase  25.9 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  33.55 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  32.6 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  36.12 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  30.8 
 
 
460 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  34.75 
 
 
474 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  32.95 
 
 
461 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02920  argininosuccinate lyase  32.48 
 
 
464 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  32.17 
 
 
471 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  32.75 
 
 
471 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  33.19 
 
 
472 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  35.55 
 
 
468 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  32.82 
 
 
472 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  31.12 
 
 
461 aa  194  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3557  argininosuccinate lyase  25.68 
 
 
502 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000176741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7298  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  32.93 
 
 
456 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  28.98 
 
 
470 aa  194  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2437  fumarate lyase  37.7 
 
 
477 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3343  argininosuccinate lyase  25.68 
 
 
502 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3604  argininosuccinate lyase  25.68 
 
 
502 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0284703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 
467 aa  193  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
467 aa  193  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  31.87 
 
 
470 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  33.83 
 
 
458 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  32.61 
 
 
494 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  32.14 
 
 
462 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 
473 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 
460 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 
466 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  32.69 
 
 
458 aa  190  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  33.63 
 
 
471 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  31.06 
 
 
463 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  31.74 
 
 
466 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  28.77 
 
 
459 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  29.21 
 
 
485 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  31.12 
 
 
466 aa  188  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  31.81 
 
 
466 aa  188  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  34.55 
 
 
502 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  28.77 
 
 
459 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>