More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2392 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  100 
 
 
499 aa  1009    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  55.96 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  42.8 
 
 
509 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  42.39 
 
 
500 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  42.51 
 
 
513 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  40.92 
 
 
510 aa  329  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  37.61 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  35.52 
 
 
492 aa  251  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  35.76 
 
 
474 aa  247  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 
487 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  34.83 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  33.48 
 
 
491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  32.4 
 
 
487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  31.61 
 
 
481 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  34.75 
 
 
499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
499 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  31.18 
 
 
481 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  30.97 
 
 
481 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  34.57 
 
 
491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  34.91 
 
 
462 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  34.91 
 
 
462 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  33.12 
 
 
493 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  31.15 
 
 
481 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  35.04 
 
 
520 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  32.69 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 
458 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  35.07 
 
 
461 aa  219  8.999999999999998e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 
460 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  34.72 
 
 
462 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 
458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  33.69 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4017  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.62 
 
 
461 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  31.25 
 
 
504 aa  211  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2629  argininosuccinate lyase  31.56 
 
 
499 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.367608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 
459 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  34.64 
 
 
459 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3858  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 
467 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1520  argininosuccinate lyase  31.26 
 
 
466 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  32.58 
 
 
461 aa  209  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  33.69 
 
 
467 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  33.5 
 
 
466 aa  209  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  33 
 
 
458 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2536  argininosuccinate lyase  33.86 
 
 
467 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3565  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 
466 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754251  normal  0.282214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 
462 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  35.15 
 
 
469 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  33.48 
 
 
473 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  32.73 
 
 
462 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  34.4 
 
 
459 aa  207  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  33.92 
 
 
464 aa  207  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
462 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  35.38 
 
 
502 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  31.19 
 
 
471 aa  206  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
462 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  35.78 
 
 
478 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 
462 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  36.17 
 
 
466 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0936  argininosuccinate lyase  35 
 
 
465 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  30.91 
 
 
458 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  34.4 
 
 
481 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  32.88 
 
 
466 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  35.08 
 
 
457 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0827  argininosuccinate lyase  34.85 
 
 
465 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332857  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  32.88 
 
 
493 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 
463 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  32.51 
 
 
463 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  34.7 
 
 
462 aa  203  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
466 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  31.83 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  34.77 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  30.9 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  34.19 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0715  argininosuccinate lyase  34.31 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  35.04 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  30.47 
 
 
462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  32.43 
 
 
462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  34.3 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  31.29 
 
 
463 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 
471 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  33.92 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0158  argininosuccinate lyase  32.01 
 
 
458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  32.18 
 
 
460 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  30.65 
 
 
460 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  33.91 
 
 
470 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  31.91 
 
 
459 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  31.91 
 
 
459 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
459 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3308  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 
502 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  35.2 
 
 
458 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  32.81 
 
 
463 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  38.02 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>