More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4342 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  88.58 
 
 		 509 aa  909    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  80.44 
 
 		 513 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  100 
 
 		 500 aa  1023    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  50.4 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  42.89 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  38.74 
 
 		 499 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  35.89 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  33.99 
 
 		 487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  32.84 
 
 		 481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  34.28 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  33.04 
 
 		 481 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  34.57 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  33.68 
 
 		 491 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  35.41 
 
 		 494 aa  240  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  36.13 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  33.69 
 
 		 499 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  34.57 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.02 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  33.19 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 462 aa  223  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 462 aa  223  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 		 463 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.8 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 462 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 462 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  31.97 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  33.1 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  32.83 
 
 		 487 aa  221  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.73 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  32.08 
 
 		 462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.18 
 
 		 493 aa  217  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  32.89 
 
 		 492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  34.48 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  31.77 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  32.73 
 
 		 460 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  35.64 
 
 		 478 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  35.19 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  34.39 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  32.34 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  33.48 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  33.26 
 
 		 463 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  35.73 
 
 		 471 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 		 502 aa  206  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  31.25 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 		 554 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  34.15 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 		 464 aa  203  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.18 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  36.27 
 
 		 467 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  33.66 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  33.99 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  34.48 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  34.95 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  33.1 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  30.89 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  34.23 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  31.35 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1145  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  33.82 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 490 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  35.2 
 
 		 469 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  30.49 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  33.9 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  34.27 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  31.61 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  34.52 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 		 469 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  32.82 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  31.66 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  34.13 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  33.65 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  30.91 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  34.72 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  33.69 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  34.61 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  35.83 
 
 		 467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 		 461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  35.23 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  31.91 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  35.01 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  31.28 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  34.34 
 
 		 491 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>