More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4391 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3820  argininosuccinate lyase  81.44 
 
 		 509 aa  847    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.99929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4391  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 513 aa  1044    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4342  fumarate lyase  80.44 
 
 		 500 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2366  argininosuccinate lyase  51.78 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2392  argininosuccinate lyase  42.68 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2390  argininosuccinate lyase  40.33 
 
 		 499 aa  356  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  35.96 
 
 		 491 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  35.08 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  32.65 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  33.54 
 
 		 481 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0564  argininosuccinate lyase  36.24 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  32.52 
 
 		 481 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  33.54 
 
 		 481 aa  256  8e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  36.4 
 
 		 487 aa  249  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 		 491 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  37.28 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  36.21 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  35.76 
 
 		 492 aa  238  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 		 499 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 		 492 aa  230  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  36.98 
 
 		 478 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 		 461 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  34.1 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  34.62 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  32.95 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  32.95 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  32.95 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  32.95 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.64 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 		 463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  34.45 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  34.91 
 
 		 468 aa  223  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  34.42 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  34.04 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  34.04 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  35.39 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.36 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  36.69 
 
 		 467 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  36.57 
 
 		 467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1219  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  35.04 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  35.21 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  35.11 
 
 		 490 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  37.87 
 
 		 471 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0718  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  33.96 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1608  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2295  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1067  argininosuccinate lyase  36.73 
 
 		 469 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  33.83 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  31.45 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  36.49 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  36.6 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  35.28 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  35.28 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  35.52 
 
 		 464 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  35.28 
 
 		 464 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  36.69 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  36.58 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  36.49 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  31.63 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  32.68 
 
 		 458 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  36.67 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  34.86 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  32.34 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  35.58 
 
 		 491 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  33.47 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  32.9 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5760  argininosuccinate lyase  36.34 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  33.41 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1818  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1201  argininosuccinate lyase  35.1 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.167565  normal  0.645493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2429  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26580  argininosuccinate lyase  31.59 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000988334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  34.67 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  37.73 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  34.87 
 
 		 502 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0655  argininosuccinate lyase  33.79 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.928445  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0054  argininosuccinate lyase  32.39 
 
 		 466 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  35.89 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  32.13 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  34.34 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  32.34 
 
 		 461 aa  203  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  34.07 
 
 		 470 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2363  argininosuccinate lyase  36.36 
 
 		 471 aa  203  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  33.83 
 
 		 469 aa  203  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  32.54 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  35.42 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>