More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4737 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4737  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 330 aa  630  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251468  hitchhiker  0.00235466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0378  Monosaccharide-transporting ATPase  63.73 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4343  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  64.41 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2023  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.87 
 
 		 312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  36.84 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  37 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.82 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.78 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.46 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.78 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.14 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.14 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  39.79 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.51 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.51 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.28 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.37 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.28 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.52 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.81 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.58 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  39.04 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  38.91 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 388 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  41.7 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.2 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.99 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  35.9 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.75 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.97 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  37.19 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  37.19 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.48 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.66 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  38.23 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.33 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.59 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.72 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  35.91 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 354 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.24 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  36.47 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  36.91 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  36.72 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.65 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.65 
 
 		 335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.58 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 		 835 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.71 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 		 324 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  38.11 
 
 		 365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  36.46 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>