More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2023 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2023  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4737  monosaccharide-transporting ATPase  53.23 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251468  hitchhiker  0.00235466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0378  Monosaccharide-transporting ATPase  54 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4343  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  54.67 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.2 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  41.8 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.48 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.48 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.16 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.84 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.84 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  42.91 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  37.1 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.42 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  40.84 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  39.23 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.52 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.43 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  36.09 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  36.76 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.53 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  38.94 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  40.6 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  38.55 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  38.55 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.13 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  36.9 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.72 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  33.94 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.66 
 
 		 835 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  39.48 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.66 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.16 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.66 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  37.13 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  37.69 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  37.69 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.34 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  37.03 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.39 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  38.48 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  36.17 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.81 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.81 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  37.29 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  37.29 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  38.48 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.63 
 
 		 346 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.14 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  39.23 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  37.98 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.61 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  37.88 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.04 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  36.31 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  40.91 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  36.88 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  35.06 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.76 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  36.92 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  34.97 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2213  monosaccharide-transporting ATPase  45.98 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00485978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  36.59 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>