More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4343 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4343  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 319 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0378  Monosaccharide-transporting ATPase  98.43 
 
 		 319 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4737  monosaccharide-transporting ATPase  64.82 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.251468  hitchhiker  0.00235466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2023  inner-membrane translocator  55.1 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.58 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  39.87 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  39.54 
 
 		 311 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.58 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  39.54 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.22 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.22 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  39.22 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  39.22 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 346 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  39.74 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.1 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  38.85 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  38.83 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 317 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  38.73 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  39.32 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  39.24 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  36.15 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  38.59 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  38.59 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  38.26 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  40.97 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  39.18 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.13 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  38.28 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36.94 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.93 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 		 348 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.22 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.85 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  39.22 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.85 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.24 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.39 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  38.35 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.56 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 835 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  37.62 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  37.62 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  37.62 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  37.62 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  40.14 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  37.26 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.2 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  37.9 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  36.25 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  36.25 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.6 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  37.3 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.95 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  36.64 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  36.18 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  36.64 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>