More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3128 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3128  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  487  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01555  hypothetical protein  83.26 
 
 
242 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0940  hypothetical protein  76.37 
 
 
244 aa  350  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1059  hypothetical protein  75.53 
 
 
244 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  60.58 
 
 
248 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  62.55 
 
 
239 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  62.07 
 
 
239 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  62.07 
 
 
239 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  57.56 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  57.26 
 
 
248 aa  277  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  58.37 
 
 
240 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  61.28 
 
 
239 aa  275  4e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  62.07 
 
 
249 aa  272  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  58.97 
 
 
243 aa  269  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  57.45 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.6 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.6 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  56.43 
 
 
248 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  54.13 
 
 
246 aa  266  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  53.94 
 
 
248 aa  265  5e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  57.51 
 
 
241 aa  263  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  55.19 
 
 
248 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  54.04 
 
 
239 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  54.47 
 
 
248 aa  262  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  56.78 
 
 
249 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  54.47 
 
 
248 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  54.47 
 
 
248 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  54.47 
 
 
248 aa  262  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  54.77 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  54.77 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  54.89 
 
 
248 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  54.04 
 
 
247 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  53.94 
 
 
248 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  58.26 
 
 
241 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  54.85 
 
 
247 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  54.04 
 
 
248 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  56.65 
 
 
241 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  54.89 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  58.72 
 
 
241 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  56.9 
 
 
245 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  53.19 
 
 
247 aa  254  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  53.85 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  53.85 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  54.04 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  54.04 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  53.62 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  52.77 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  51.91 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1967  hypothetical protein  57.81 
 
 
243 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445597  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  52.34 
 
 
247 aa  251  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  59.15 
 
 
241 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.78 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  58.26 
 
 
242 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  57.8 
 
 
242 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  53.19 
 
 
246 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  53.19 
 
 
246 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  57.8 
 
 
242 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  50.62 
 
 
248 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  53.19 
 
 
246 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  53.19 
 
 
246 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2075  hypothetical protein  56.07 
 
 
244 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.967436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  56.11 
 
 
241 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.94 
 
 
248 aa  248  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  54.66 
 
 
249 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  52.77 
 
 
246 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  57.34 
 
 
242 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  51.87 
 
 
248 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  56.42 
 
 
242 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  53.36 
 
 
247 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  51.91 
 
 
248 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  53.62 
 
 
246 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  53.19 
 
 
247 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  55.96 
 
 
242 aa  245  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  51.06 
 
 
248 aa  244  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.52 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0785  hypothetical protein  55.5 
 
 
241 aa  244  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356846  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4238  hypothetical protein  57.02 
 
 
239 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.800769  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  51.91 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>