165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0104 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0104  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  700    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0271109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03574  hydrolase, alpha/beta fold family protein  66.36 
 
 
329 aa  431  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.963575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  46.41 
 
 
325 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1295  hypothetical protein  38.66 
 
 
326 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00733606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1010  Alpha/beta hydrolase  28 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292971  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  31.72 
 
 
342 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  26.65 
 
 
353 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
332 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
342 aa  87  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  28.65 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  28.62 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  29.17 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  28.04 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  28.61 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  27.3 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  25.81 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1657  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  27.41 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35027  predicted protein  23.42 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  24.77 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  25.68 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  26.32 
 
 
335 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  27.33 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  27.69 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  27.36 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5206  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.62 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  28.3 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  26.3 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  25.73 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  24.85 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  26.18 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  26.04 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  25.94 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  25.77 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.16 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3741  alpha/beta hydrolase  26.54 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  26.04 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  26.05 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1653  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.83 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 
354 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  29.44 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  25.32 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  26.48 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  26.54 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  27.3 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  27.42 
 
 
331 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  27.98 
 
 
337 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  27.14 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
356 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  26.49 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  24.15 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  28.4 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  26.49 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  26.49 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  24.24 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0582  hypothetical protein  25.86 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00195115  normal  0.0344237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  23.03 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>