166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1295 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1295  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  675    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00733606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0172  alpha/beta hydrolase fold  40.63 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.34441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0104  hypothetical protein  38.66 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0271109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03574  hydrolase, alpha/beta fold family protein  38.92 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.963575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1010  Alpha/beta hydrolase  25.85 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292971  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  26.14 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  24.92 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  24.61 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  25 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  26.4 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  21.25 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  25.79 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  26.33 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  25.79 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  25.79 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  25.79 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  25.79 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  25.79 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4611  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000000220709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1657  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  25.47 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  26.01 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  26.1 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  25.47 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  25.96 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  26.1 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  25.96 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  25.96 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  25.16 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  25.95 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  23.26 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  25.62 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  26.25 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  24.32 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  24.31 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  27.2 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13091  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  23.1 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.6 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  23.2 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13341  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  23.76 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  24.64 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  25.98 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  25.79 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  29.63 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1499  Alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.485518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1241  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  22.65 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.488852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  23.6 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  22.98 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  26.71 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  24.47 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  24.34 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  24.47 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  24.47 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  24.15 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  25.55 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>