24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3811 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  39.69 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  37.07 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  29.85 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  30.15 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  32.56 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  31.82 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  32.31 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  31.36 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  28.46 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  28.81 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  30.66 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.54796 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  37.8 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  28.36 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  28.45 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  27.74 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4095  hypothetical protein  32.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  25.93 
 
 		 123 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>