18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0380 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  71.01 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  69.57 
 
 		 138 aa  209  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  37.98 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  29.85 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2267  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1327  protein of unknown function DUF1123  34.38 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01837  hypothetical protein  34.68 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.185242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3191  hypothetical protein  38.76 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1071  hypothetical protein  35.79 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.259445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2544  hypothetical protein  34.35 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  34.02 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  30.38 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3065  hypothetical protein  36.62 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.100645  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>