16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1194 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1194  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  289  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.66079  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1789  hypothetical protein  58.04 
 
 
144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1193  hypothetical protein  47.93 
 
 
144 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0476503  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4661  hypothetical protein  44.76 
 
 
144 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1788  hypothetical protein  43.94 
 
 
142 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0645  hypothetical protein  39.86 
 
 
140 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368313  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5576  protein of unknown function DUF1123  43.17 
 
 
152 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03510  conserved hypothetical protein  43.2 
 
 
507 aa  94.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4577  hypothetical protein  38.03 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03979  conserved hypothetical protein  41.35 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140824  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0479  protein of unknown function DUF1123  31.19 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671758  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1100  hypothetical protein  30.25 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000107053  normal  0.0128168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3811  hypothetical protein  27.74 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1176  hypothetical protein  26.67 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281538  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0380  hypothetical protein  30.38 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0436  protein of unknown function DUF1123  27.78 
 
 
138 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>